組織架構
| 校長 | |
| 行政副校長 | 學術副校長 |
行政單位
| 教務處 | 學生事務處 | 總務處 | 研究發展處 | 國際事務處 | 圖書與資訊處 |
| 教學資源組 註冊組 招生試務組 課務組 教學發展中心 | 生活輔導組 課外活動輔導組 衛生保健組 畢業生輔導暨校友服務組 諮商輔導組 體育組 | 文書組 事務組 出納組 保管組 營繕組 環保組 安保組 | 推廣組 企劃組 業務組 | 綜合業務組 學術交流組 學生交流組 僑生與外籍生事務組 | 綜合業務組 採錄編目組 閱覽典藏組 參考諮詢組 系統發展組 資訊應用組 網路系統組 |
| 推廣教育處 | 藝文中心 | 秘書室 | 人事室 | 會計室 | |
| 進修教育組 推廣服務組 外國語文教學中心 華語教學中心 | 展演組 管理組 | 綜合業務組 公關資源組 | 第一組 第二組 | 第一組 第二組 第三組 | |
學術單位
| 文學院 | 理學院 | ||
| 中國文學系(含碩、博士班、碩士在職專班、暑期碩士在職專班) 外國語文學系(含碩、博士班、二年制在職專班) 音樂學系(含碩士班) 劇場藝術學系(含碩士班) 哲學研究所(碩士班) | 化學系(含碩、博士班) 物理學系(含碩、博士班、碩士在職專班) 生物科學系(含碩、博士班、碩士在職專班) 應用數學系(含碩、博士班) 生物醫學研究所(碩、博士班、碩士在職專班) | ||
| 工學院 | 管理學院 | ||
| 電機工程學系(含碩、博士班、碩士在職專班、寬頻通訊網路產業研發碩士專班) 機械與機電工程學系(含碩、博士班、碩士在職專班、半導體封裝測試產業研發碩士專班) 資訊工程學系(含碩、博士班) 材料與光電科學學系(含碩、博士班) 光電工程學系(含碩、博士班) 環境工程研究所(碩、博士班、碩士在職專班) 通訊工程研究所(碩、博士班) 電機電力工程國際碩士學位學程 | 企業管理學系(含碩、博士班、碩士在職專班) 資訊管理學系(含碩、博士班、碩士在職專班、電子商務碩士在職專班) 財務管理學系(含碩、博士班、二年制在職專班、碩士在職專班) 公共事務管理研究所【碩、博士班、碩士在職專班、碩士在職專班（澎湖班）】 人力資源管理研究所【碩、博士班、碩士在職專班、（企業家人力資源管理）碩士在職專班】 傳播管理研究所(碩士班、碩士在職專班) 醫務管理研究所(碩士班) 醫務管理碩士學位學程 高階經營碩士學程在職專班 國際經營管理碩士學程 | ||
| 海洋科學學院 | 社會科學院 | ||
| 海洋生物科技暨資源學系(含碩、博士班) 海洋環境及工程學系(含碩、博士班、碩士在職專班) 海洋生物研究所(碩、博士班) 海洋地質及化學研究所(碩、博士班) 海下科技暨應用海洋物理研究所(碩士班) 海洋事務研究所(碩士班) 海洋生物科技博士學位學程 海洋科學學士學位學程 | 政治經濟學系(政治組、經濟組) 中國與亞太區域研究所(碩、博士班、碩士在職專班) 政治學研究所(碩、博士班、碩士在職專班) 經濟學研究所(碩士班、碩士在職專班) 教育研究所(碩、博士班、教師在職進修教學及學校行政碩士學位班) 社會學研究所(碩士班) 師資培育中心 高階公共政策碩士學程在職專班 | ||
| 通識教育中心 | 編制內一級研究中心 | ||
| 人文與社會科學教育組 自然與應用科學教育組 體育健康與服務教育組 | 工程技術研究推展中心 管理學術研究中心 人文社會科學研究中心 海洋前瞻科技推展中心 | ||
| 發展國際一流大學及頂尖研究中心 | |||
| 尖端晶體光電科技中心 亞太海洋研究中心 微奈米分析技術研發中心 電子商務與科技創新研究中心 中山-高醫跨校研究中心 人文社會科學研究中心 國家政策研究中心 無線通訊天線研究中心 非線性分析及離散數學研究中心 | |||
| 任務編組研究中心 | |||
| 一級中心 | 二級中心 | ||
|
神經科學研究中心
海洋科技研究中心 水資源研究中心 南台灣光電卓越研究中心 電子商務研究中心 海洋政策研究中心 奈米科技研發中心 中山大學與工業技術研究院光電聯合研發中心 中山大學建準研發中心 中山大學貴重暨共用儀器中心 創新育成中心 創意與創新研發中心 產學營運中心 南區促進產業發展研究中心 國立中山大學暨資策會學研聯合中心 綠色環境研究中心(至合約計畫執行結束日裁撤) | 文學院 | 清代學術研究中心 | |
| 工學院 | 半導體科技研究發展中心 電信研究發展中心 | ||
| 管理學院 | 都會發展與環境規劃研究中心 城鄉與地方發展研究中心 南區中小企業研訓中心 | ||
| 社科院 | 民意調查研究中心 | ||
| 三級中心 | |||
| 管理學院 | 傳播管理研究所 | 數位抄襲防治研究中心 | |
| 社科院 | 中國與亞太區域研究所 | 國際非政府組織研究中心 | |